深圳皇岗口岸是亚洲最大的陆路口岸，也是目前深港之间唯一24小时开放的口岸，来往皇岗口岸的客流主要以公路运输的方式为主，绝大多数旅客乘坐客运大巴或自驾车前往，自行前往口岸的旅客并不多。
到达皇岗口岸后，需要通过天桥进入联检大厅
进入出境大厅后，可选择人工柜台或自助通道办理出境手续。由于皇岗口岸团队旅客数量巨大，经常需要排较长时间的队，对于可以使用自助通关的旅客，建议尽量采用自助通关的方式。
从中国边检出境后，就到达了口岸的客运站，绝大多数的旅客都是团队游客或乘坐过境的大巴离开，散客可以在客运站自行购买前往香港各地的车票。皇岗口岸的大巴可以前往香港绝大多数主要地点，如香港机场，迪士尼，尖沙咀，荃湾，湾仔，锦上路等，乘客可以使用港币或人民币以及八达通购票，建议提前备好港币或八达通。
深圳皇岗口岸对应香港一侧为落马洲管制站，对于不想乘坐大巴直接前往香港市区的旅客，也可以选择乘坐俗称“皇巴”的口岸穿梭巴士前往落马洲管制站。“皇巴”票价为港币9元，可使用八达通付费，“皇巴”24小时运行，车次5-10分钟一班。
无论是乘坐何种类型的巴士前往香港，都需要乘车至香港落马洲管制站后下车进行香港入境检查，一般来说落马洲管制站的旅客数量也非常多，排队过关时间较长，符合自助通关条件的旅客可选择“e道”通关。
完成香港入境手续之后，可以前往客运站继续乘坐之前所乘的车辆前往市区，如果错过了来时的大巴一班也没关系，可以持票乘坐下一辆同一目的地的大巴。由于这个车站路线非常多，注意不要乘错方向。
“皇巴”的深圳乘车地点为皇岗口岸旅检大楼南侧的穿梭巴士候车室，香港乘车地点为新界新田公共交通转车站，乘坐“皇巴”前往香港的旅客可以在新田乘坐B1前往元朗和天水围，也可以乘坐新界绿巴75路前往元朗等地。
深圳：
往来深圳宝安国际机场可以乘坐深圳机场9号线，票价20元，运营时间8:00-22:00。
皇岗口岸没有地铁，目前深圳地铁7号线西丽线正在施工，设有皇岗口岸站，预计2016年通车。从深圳市区前往皇岗口岸可选择公交车或出租车前往。
香港：
从香港市区前往皇岗口岸可在市区各跨境巴士点乘坐跨境巴士。
如想自行前往落马洲管制站可乘坐44B,77,277等至新田转车站转乘“皇巴”前往落马洲管制站及皇岗口岸。