北海最主要的客运码头是北海国际客运港，这里是北海唯一去涠洲岛及海南岛的船舶港口。从北海客运码头到海口是每天傍晚18:00准时开船。

北海至涠洲岛，每天开多少班航班是根据当时人流量及天气状况来决定的，一般在前一天下午公布第二天的航班。每天常规航班是往返各三趟，去程：8:30、11:30、16:00；返程：10:00、14:30、17:00（船票航班时间前后会有1-1.5小时浮动）。重大节假日、大风等恶劣天气情况，航班调整较大，具体以客运港公示为准。

一般正常情况下都是开快船，慢船只有在风浪大或者节假日游客较多的情况下才会开。名称以“飞”开头的船身较小，载客量相对少，较颠簸，相对易晕船、呕吐，行程需约1-1.5小时。若想避免晕船，可选择船身较大的“北游12”、“北游8”（原北部湾1、3号已分别更名），载客量大，相对平稳，如易晕船的游客坐该船会舒服很多，行程则会根据淡旺季有所变动，约1-2小时左右。但海运开航船是根据天气及运力情况而定，无法人为指定，也无法提前确定具体航行的船只名称。慢船一般执行北海至海口航线，在出现恶劣天气、涠洲岛旅游旺季快船运力不足情况下，海运公司有可能取消海口航线，调整运力到涠洲航线，因存在众多不确定因素，海运公司不予提前预订。

海运快船和慢船B舱的票价均为120元，A舱为180元。然而也并非每艘船都有A舱，如北游6号、8号这两艘船都是统一120元/座舱位。若所乘船只有AB舱之分，可在船上直接补钱升舱（但若是担心晕船选择A舱，则无必要，因为A舱在二楼，若是风浪大，楼上相对楼下，其实会更晕一些）。

1、北海近日规定：为确保涠洲岛运输秩序，缓解旅游旺季及节假日购票紧张局面，打击非法炒票行为，自2013年9月30日起正式实行船票实名购票机制。
按照新出台的涠洲岛船票实名制，游客购买往返涠洲岛船票须凭二代居民身份证船票，年龄小于16岁的游客如无身份证可以持户口页购票，军官、外宾等游客可持军官证、护照购票。检票时，游客需凭当日船票和身份证件进入候船厅候船，并在检票时查验有效证件。每张身份证件只能购买一天的往返船票（去和返）。如忘记携带二代身份证的游客需要购买船票，可以到北海国际客运港派出所开具身份证明后，携带相关证明到售票口购票。

2、乘船是前往涠洲岛唯一途径，航班很少，旺季会多加开十多趟船班。最好在出行前计划好在岛上呆几天，提前2-3天买好去程或一次性买好往返船票，以免发生无法买到船票的情况。订票方式有：（1）7:00-8:00抵达北海国际客运港去买，或是一放好行李就去买第二天的票，一般第二天的还是买得到的；（2）在网上，或让旅行社、住宿老板等代理帮忙预订，部分需手续费；（3）船票每日数量有限，旺季情况下，会有不少船票集中在票贩子手上，高价出售，一般为原票价再加一半价，即120元原票价，因此会出价180元或更高；（5）回程船票可在南湾市场旁的金色海岸宾馆购买，不需手续费。若实在买不到回程票，也不要着急，可让住宿老板帮忙先上船，下船后再补站票。

3、航班在特殊情况下，如天气（如有台风或海面风力达7级以上，海轮会停运）等不可抗力因素，发布的一般都是预计情况，一切以气象预报、内部安全评估、海事部门许可后的航班通告为准。所以在出行前一定要关注天气变化，了解实时更新的航班信息发布。因此若下了船要赶火车或飞机的游客，一定要注意预留足够时间，因为海上风浪情况难测，即便买的快船票（航行时间60分钟），可能会因风浪太大临时被换成慢船（航行时间150分钟），开船时间也会延后，就有耽误乘机（车）的情况。

4、晕船的可以提前吃晕船药或买贴在耳根的晕车贴，缓解症状；或者尽量靠近船尾坐，因为船头起伏相对厉害（座位号数大的位置较靠后）。

5、航行途中要注意船上的安全标识，救生艇、应急门的方位，救生衣一般都在座位下，船上会准备塑料袋和防止晕船的药物等。