漠河火车站非常小，位于县城西北侧，距离县中心约3.5km，打车10元，约5分钟到达县中心。

到目前漠河火车站只有发往哈尔滨、加格达奇和大连等地的班次火车，多数到漠河旅游的游客，都是先到哈尔滨，在哈尔滨转乘到漠河的火车，再由漠河乘坐汽车到景区。从哈尔滨乘坐火车前往漠河，车程20个小时左右。晚上到达，可当晚包车去北极村，当天往返车费150元左右，也可等次日坐长途车。

另外，漠河所辖的图强镇也有个小型火车站，游客也可以选择在此落脚，图强到漠河县城也很方便。