深圳水上客运主要有蛇口、福永等8个港口，一共有12个码头。、

蛇口码头
蛇口客运港位于蛇口港澳大道与南海大道交接口，每天都有往来于珠海、广州、澳门、香港、九龙的定期航班。
交通：乘深圳至蛇口港中巴419、439路抵达。
国内线电话：0755-26695601
港澳线电话：0755-26691213

福永码头
宝安机场福永码头每天有往返香港上环信德中心港澳码头、香港九龙中港城码头（航程一小时）和香港机场海天码头（45分钟，每天18班）的高速客轮，还有开往澳门（新港澳码头）的7班快艇，航程一小时。机场候机楼前设有接驳到福永码头的免费巴士。