到达南麂岛的一般路线是目的地——温州市平阳县敖江镇(或者温州市、瑞安县)——乘船到达景区。高铁在鳌江设站,因此,如果去南麂岛,可以由铁路中转至鳌江,之后上岛,非常方便。鳌江站有始发苍南、六安、温州南、厦门、厦门北、福州、福州南、上海虹桥、宁波东、杭州、温州南、南京 、龙岩的火车。